Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PapolbQ9WVP6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PapolbQ9WVP6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms