Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slit3Q9WVB4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Slit3Q9WVB4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Slit3Q9WVB4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms