Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srd5a3Q9WUP4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srd5a3Q9WUP4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms