Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema6cQ9WTM3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sema6cQ9WTM3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms