Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Psma4Q9R1P0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psma4Q9R1P0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms