Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1I1

Chst4, Carbohydrate sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst4Q9R1I1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chst4Q9R1I1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chst4Q9R1I1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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