Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hsf4Q9R0L1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hsf4Q9R0L1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms