Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Zeb2Q9R0G7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Zeb2Q9R0G7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Zeb2Q9R0G7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms