Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fhl3Q9R059 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms