Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp21Q9QZL6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp21Q9QZL6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp21Q9QZL6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp21Q9QZL6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp21Q9QZL6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Usp21Q9QZL6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp21Q9QZL6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp21Q9QZL6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Usp21Q9QZL6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Usp21Q9QZL6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Usp21Q9QZL6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms