Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ11

Exo1, Exonuclease 1, mousemouse

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Length 837 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo1Q9QZ11 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Exo1Q9QZ11 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Exo1Q9QZ11 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms