Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Abcb11Q9QY30 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Abcb11Q9QY30 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms