Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt17Q9QWL7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt17Q9QWL7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms