Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Chaf1aQ9QWF0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Chaf1aQ9QWF0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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