Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LitafQ9JLJ0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LitafQ9JLJ0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms