Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2l2Q9JLG4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2l2Q9JLG4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2l2Q9JLG4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pkd2l2Q9JLG4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkd2l2Q9JLG4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkd2l2Q9JLG4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pkd2l2Q9JLG4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pkd2l2Q9JLG4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pkd2l2Q9JLG4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms