Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Upk3aQ9JKX8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Upk3aQ9JKX8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms