Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lmx1aQ9JKU8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lmx1aQ9JKU8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms