Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Habp4Q9JKS5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Habp4Q9JKS5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Habp4Q9JKS5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms