Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rcan3Q9JKK0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rcan3Q9JKK0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan3Q9JKK0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan3Q9JKK0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan3Q9JKK0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan3Q9JKK0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan3Q9JKK0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan3Q9JKK0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan3Q9JKK0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcan3Q9JKK0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms