Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tuba8Q9JJZ2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Tuba8Q9JJZ2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Tuba8Q9JJZ2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Tuba8Q9JJZ2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Tuba8Q9JJZ2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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Tuba8Q9JJZ2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tuba8Q9JJZ2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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