Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN2

Zfhx4, Zinc finger homeobox protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 3,550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfhx4Q9JJN2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfhx4Q9JJN2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfhx4Q9JJN2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfhx4Q9JJN2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfhx4Q9JJN2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfhx4Q9JJN2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfhx4Q9JJN2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfhx4Q9JJN2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfhx4Q9JJN2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfhx4Q9JJN2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfhx4Q9JJN2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfhx4Q9JJN2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zfhx4Q9JJN2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfhx4Q9JJN2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfhx4Q9JJN2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfhx4Q9JJN2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfhx4Q9JJN2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfhx4Q9JJN2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zfhx4Q9JJN2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zfhx4Q9JJN2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfhx4Q9JJN2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfhx4Q9JJN2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zfhx4Q9JJN2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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