Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ59

Abcb9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, mousemouse

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb9Q9JJ59 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcb9Q9JJ59 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcb9Q9JJ59 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcb9Q9JJ59 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcb9Q9JJ59 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcb9Q9JJ59 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcb9Q9JJ59 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcb9Q9JJ59 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Abcb9Q9JJ59 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcb9Q9JJ59 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcb9Q9JJ59 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcb9Q9JJ59 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Abcb9Q9JJ59 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Abcb9Q9JJ59 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms