Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn12Q9ET43 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cldn12Q9ET43 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms