Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Zcchc17Q9ESX4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zcchc17Q9ESX4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zcchc17Q9ESX4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms