Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESU6

Brd4, Bromodomain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd4Q9ESU6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Brd4Q9ESU6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Brd4Q9ESU6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Brd4Q9ESU6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Brd4Q9ESU6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms