Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ush1cQ9ES64 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ush1cQ9ES64 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ush1cQ9ES64 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms