Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ube3bQ9ES34 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube3bQ9ES34 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ube3bQ9ES34 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms