Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SelenofQ9ERR7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SelenofQ9ERR7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms