Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Wdr61Q9ERF3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Wdr61Q9ERF3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms