Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI5

Ppbp, Chemokine (C-X-C motif) ligand 7, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpbpQ9EQI5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PpbpQ9EQI5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PpbpQ9EQI5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PpbpQ9EQI5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PpbpQ9EQI5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PpbpQ9EQI5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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