Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mmp1bQ9EPL6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp1bQ9EPL6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms