Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Aph1cQ9DCZ9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Aph1cQ9DCZ9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms