Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufa8Q9DCJ5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufa8Q9DCJ5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms