Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fundc1Q9DB70 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fundc1Q9DB70 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.9 ms