Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx5Q9D8U8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx5Q9D8U8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms