Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rexo2Q9D8S4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rexo2Q9D8S4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms