Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Gtf3c6Q9D8P7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gtf3c6Q9D8P7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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