Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dnajc4Q9D844 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dnajc4Q9D844 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms