Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Fip1l1Q9D824 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Fip1l1Q9D824 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms