Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn9Q9D805 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn9Q9D805 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn9Q9D805 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn9Q9D805 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn9Q9D805 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn9Q9D805 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn9Q9D805 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn9Q9D805 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn9Q9D805 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn9Q9D805 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn9Q9D805 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn9Q9D805 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn9Q9D805 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn9Q9D805 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn9Q9D805 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms