Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13Q9D777 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf13Q9D777 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms