Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ttc9bQ9D6E4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ttc9bQ9D6E4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ttc9bQ9D6E4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
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