Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D4W2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D4W2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Q9D4W2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D4W2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D4W2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Q9D4W2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms