Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
4933428M09RikQ9D3X3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
4933428M09RikQ9D3X3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
4933428M09RikQ9D3X3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms