Protein–RNA interactions for Protein: Q9D253

9330161L09Rik, RIKEN cDNA 9330161L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9330161L09RikQ9D253 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
9330161L09RikQ9D253 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
9330161L09RikQ9D253 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms