Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nol3Q9D1X0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Nol3Q9D1X0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms