Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Necap2Q9D1J1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Necap2Q9D1J1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms