Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Mrpl53Q9D1H8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Mrpl53Q9D1H8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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