Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

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Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Elp3Q9CZX0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Elp3Q9CZX0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms